Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CARTPTQ16568 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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