Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TNXAQ16473 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TNXAQ16473 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TNXAQ16473 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TNXAQ16473 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TNXAQ16473 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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