Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms