Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms