Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
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EEA1Q15075 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EEA1Q15075 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
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