Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms