Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNIP1Q15025 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms