Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME4Q14997 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME4Q14997 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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