Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RAB39AQ14964 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RAB39AQ14964 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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