Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms