Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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