Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms