Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PKP1Q13835 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PKP1Q13835 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PKP1Q13835 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PKP1Q13835 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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