Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms