Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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