Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms