Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PEX6Q13608 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PEX6Q13608 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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