Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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