Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPM6BQ13491 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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