Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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