Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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