Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms