Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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