Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RESTQ13127 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RESTQ13127 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RESTQ13127 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RESTQ13127 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RESTQ13127 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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RESTQ13127 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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