Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXL1Q12952 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms