Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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