Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROQ12816 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TROQ12816 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TROQ12816 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TROQ12816 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROQ12816 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROQ12816 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TROQ12816 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TROQ12816 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TROQ12816 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TROQ12816 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TROQ12816 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TROQ12816 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TROQ12816 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TROQ12816 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TROQ12816 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
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