Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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