Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms