Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFFO1Q0D2I5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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