Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD47Q08722 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms