Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms