Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL1Q08397 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms