Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms