Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FMODQ06828 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FMODQ06828 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms