Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms