Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREMQ03060 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREMQ03060 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREMQ03060 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREMQ03060 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREMQ03060 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms