Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP4A11Q02928 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms