Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms