Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC133528.1-201ENST00000608316 805 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms