Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms