Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms