Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DHODHQ02127 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms