Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms