Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms