Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms