Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms