Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms