Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms