Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms